科学研究
CAS-JIC联合研究中心拟在植物学和微生物学基础理论研究和应用研发两个方面展开工作。具体研究方向及重点领域包括作物改良以及植物和微生物高附加值天然产物的代谢机理及应用研发。
合作研究项目由中国科学院、英国生物技术和生物科学研究理事会（Biotechnology and Biological Sciences Research Council，简称BBSRC）和牛顿基金资助。
目前开展的合作研究项目主要围绕以下三个关键领域。
生长发育
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JIC合作方: Enrico Coen
IGDB合作方：薛勇彪基因组承载着其历史的痕迹，这些痕迹会为在进化期间如何产生适应性和进化提供重要线索。其中，特别令人感兴趣的是基因岛-基因岛是指表现出异常低或异常高分化程度的基因组区域。对此的一个假设认为，这些区域源于在进化过程中被多次使用的一组数量有限的等位基因，也有人认为是源于独立出现的新的功能变异。此项研究的目的是通过研究金鱼草属植物中的位于控制自交不亲和性和花颜色位点的基因岛来验证这些假说。我们希望通过在系统发育和基因组框架下研究这些位点的等位变异来确定等位基因和性状在不同谱系中是如何进化的。这将帮助我们确定基因岛如何产生、持续和衰退，以及鉴定出形成自然多样性的过程和基因，为植物育种提供材料 。
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JIC合作方: Robert Sablowski
IGDB合作方：焦雨铃植物的形状不仅为大自然的美丽做出贡献，而且影响着植物对环境的适应性和作物产量。植物形状的两个关键的决定性因素是茎高和枝芽分支的方式。
中科院遗传发育所焦雨铃课题组对分枝发育的研究和英国约翰英纳斯中心Robert Sablowski课题组对茎伸长发育的研究同时集中在名为ATH1的关键调节基因上。此基因作用于非常靠近顶端分生组织的位置。顶端分生组织是一群位于茎尖的可以持续分裂的细胞，为叶片、花和茎的形成提供新的细胞。
在此项目中，我们将结合双方的资源，以双方专业技术互为补充，以验证由ATH1的在分枝发育和茎伸长发育中的作用所推论出的其在分生组织和茎组织间的边界控制生长时的单一功能的假设。此项目将会揭示决定植物形状的基本机理，该机理将有可能在作物改良中发挥作用。
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JIC合作方： Xiaoqi Feng
IGDB合作方：杨维才在植物的生殖发育阶段会发生大规模的染色质重组。然而，这种重组的机理和功能并不清楚。我们将结合蛋白组学和基因组学，探寻雄性生殖细胞系中染色质重组的决定因素，并阐明其生物学意义。
由于生殖细胞系的适应性与生殖成功直接相关，这些问题的回答将对植物育种具有启示意义。此外，生殖细胞系是揭示染色质结构基本原理的一个很好的模型，并可以阐明如何利用这些原理来修改基因组功能。与哺乳动物相比，我们所使用的研究模型拟南芥具有更易获得大量生殖细胞和染色质突变体表型温和的优势。生殖细胞系染色质重组在植物和哺乳动物中具有共同的特征，我们的研究有可能会获得有关生殖细胞系染色质重组的开创性认知。
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JIC合作方: Mike Bevan
IGDB合作方：李云海该项目旨在挖掘拟南芥和水稻中影响种子、器官大小和产量的基因，将由约翰英纳斯中心（JIC）Mike Bevan课题组和遗传发育所（IGDB）李云海课题组合作完成。在前期的研究中，已经发现了一种在器官形成期间控制细胞增殖持续时间的新机理。该系统的组成部分的突变使发育成的器官具有更多的细胞，器官也就相应更大。该项目将更多地了解相关的机制。这些机制为人们对生物学中一个知之甚少的领域提供了新的认识。这些知识对于培育出种子产量更高的新作物具有越来越重要的意义。
作物生产
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JIC/TSL合作方: Cyril Zipfel
IGDB合作方：周俭民植物通过模式识别受体(PRRs)感知到病原体相关分子模式（PAMPs），从而触发PAMP诱发的免疫反应（PTI）。拟南芥富亮氨酸重复类受体激酶FLS2和EFR是植物中最有代表性的模式识别受体（PRRs）。配体结合引发了FLS2/EFR和共受体的LRR-RK BAK1之间的瞬间结合，从而导致了这些蛋白质间的磷酸转移作用。FLS2/EFR-BAK1复合体的直接底物是细胞质激酶，比如BIK1。BIK1是一个中央信号信号集成器，它作用于多个PRR的下游并且可能是一个共同PTI通路的合并节点。然而，我们对于BIK1的底物和相关的PBL蛋白，以及这些关键的调节因子最终是如何驱动PTI信号传导的知之甚少。此合作项目的主要目标是通过结合双方的最新研究成果和技术，来鉴定识别并研究BIK1（和PBLs）的底物，从而填补此方面研究的空白。
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JIC合作方: Christine Faulkner
PSC上海合作方: Rosa Lozano-Duran番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）是一种能造极大产量损失的番茄病害的病原体。植物防御病毒（包括TYLCV）的核心元素是RNA沉默机制。由病毒侵染激发的小分子RNAs（sRNA）是RNA沉默机制传播的移动信号；病毒本身和沉默信号都通过胞间连丝从细胞间扩散到整个植株。TYLCV的C4蛋白可以与RNA和宿主胞间连丝受体结合，被认为可以促进病毒在细胞间的传播和沉默抑制。此项目将结合Rosa Lozano-Duran实验室在植物与病毒相互作用方面的专业知识与Christine Faulkner关于胞间连丝的研究成果，来探寻C4蛋白在病毒和sRNA移动中的作用，目的是阐明病毒感染和宿主防御的机理。
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JIC合作方: Anne Osbourn
SIPPE合作方：韩斌燕麦是一种禾谷类作物，被用作食物、饲料和牧草。它具有很多独特的农艺性状，包括低投入、高生物/非生物胁迫抗性（包括赤霉病抗性）、独特的淀粉颗粒特性和健康的谷物质量。因此，对控制燕麦重要性状的基因的进一步了解在作物改良方面具有广泛的应用潜力。普通的种植燕麦（Avena sativa）的六倍体基因组大小约为11,300 Mb，科学家尚未对此基因组进行测序。最近，我们对二倍体燕麦（Avena strigosa，基因组大小3.92 Gb）组进行了测序。我们将在此重要研究进展的基础上进行以下研究：1）注释燕麦基因组序列；2）通过比较基因组学来研究燕麦与其他的作物不同的原因；3）对燕麦基因组进行挖掘，解析其特殊代谢产物的合成途径；4）建立一个反向遗传学平台原型并对其进行验证，用以在燕麦中进行功能分析。
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JIC合作方： Dale Sanders & Tony Miller
SIPPE合作方：龚继明世界上大部分地区遭受干旱和盐胁迫的影响，并且在很多最贫穷地区，这些因素限制了食品生产安全。龚教授实验室的研究表明植物在胁迫处理下会将更多的硝酸盐分配到根部，此过程被称为植物抗逆性促使硝酸盐至根部的再分配，即SINAR。硝酸盐的组织存储和长距离输都由特定的膜蛋白来介导。相关膜蛋白已被JIC的Sanders/Miller实验室鉴定。由于硝酸盐在叶片中的同化效率更高，SINAR导致了次优生长，从而利用光合组织中更大的能量和更高的碳可用率。此研究将对植物硝酸盐利用效率中SINAR反应的作用进行探讨。研究将运用多种方法来培育具有不同SINAR反应的突变体植物，从而揭示植物是如何感知和传递氮素状态的。
天然产物
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JIC合作方: Sarah O’Connor
SIPPE合作方：肖友利药用植物会产生很多次生代谢物，尤其是生物碱。这些次生代谢物具有有效的生物活性。从植物中提取的生物碱是药用化合物的一个有效的来源。例如，从中药中被鉴别出超过4000种生物碱，这些化合物中的50种已经被用作临床药物。然而，这些化合物的生产水平通常很低，人们利用这些植物生物碱的能力或者培养这类植物都具有很大的挑战性。对此类化合物的生物合成的研究，将为改进这些化合物或其类似物的生产策略创造条件。在此项目中，我们将揭示一些药用活性生物碱的生物合成途径。
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JIC合作方: Janneke Balk
IGDB合作方：凌宏清Janneke Balk博士和凌宏清教授将对植物如何感知铁元素进行研究。植物的生长需要铁，而不同植物植物在铁元素的吸收效率方面并不相同。我们膳食中的铁元素来自于水果和蔬菜对铁的吸收。
植物只会吸收它们所需要的铁，因为多余的铁会导致其中毒。为此，植物需要知道细胞中铁的含量，这样它们能够根据需要来调节对铁的吸收和利用。目前我们还不知道铁的含量是如何被植物感知的以及这些信息是如何被传送到调控机制的。两个实验室将利用已有的模式物种拟南芥中调节铁含量上具有缺陷的突变体此进行研究。这些缺陷可能是由于植物不能感知到铁导致的。
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JIC合作方: Tony Miller
IGDB合作方：童依平硝酸盐是小麦这样的谷类作物的氮元素（N）的主要来源。因此，理解谷类作物中的硝酸盐的信号传导对于提高作物对氮素的利用率具有重要价值。尽管在拟南芥中一些硝酸盐感知和信号传导调控因子已经被发现，但是我们对谷物中的相关信息知之甚少。已有研究表明，拟南芥特定的硝酸盐转运蛋白能够调控种子中硝酸盐的含量以及侧根的形成。相应地，小麦中一个由硝酸盐诱导的NAC转录因子被证明参与调控籽粒硝酸盐的含量以及侧根的形成。我们将就小麦中是否同样存在由特定转运蛋白调控的对硝酸盐敏感的途径开展相关研究。
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JIC合作方: Cathie Martin
SIPPE合作方：薛红卫众所周知，在发展中国家，加强当地基本药品的生产是当务之急。在中国，至少有五千种植物具有药用价值。山豆根可以用来治疗黄疸、肝炎、膀胱肿瘤和胎记瘤，由豆科植物越南槐的根合成。
此项目将重点研究此植物中活性物质（异戊烯基黄酮，比如sophoranone和soporadin）的生物合成途径中的相关基因，以期增加根培养物中的相应化合物的产量，将有利于其应用于治疗所需的生产规模的扩大。
研究行为
负责任研究行为是指诚信地进行科学调查的行为。它包含从事与科学研究相关的活动中对既定的专业规范和道德准则的认知和应用。
作为一个国际化的研究中心，CAS-JIC联合研究中心将根据适宜的道德、法律和专业框架、义务和标准进行科学研究。
本文件明订了在CAS-JIC联合研究中心进行负责任研究行为的总体政策。该政策将由参与机构负责执行。
指导原则
参与CAS-JIC联合研究中心研究的研究人员需遵循以下七条于负责任研究行为的指导原则：
（i）诚实-诚实地汇报研究成果（包括研究方法、对结果的解释及影响）
（ii）公平-公平地承认他人的工作和贡献
（iii）严谨-严谨地处理、报告和发表研究数据，并严谨地从数据中得出结论（包括保留原始数据）
(iv）透明-透明地进行研究成果的核算，并公开潜在的活动和利益冲突
(v) 独立-独立地遵守学术自由的准则和进行公正的研究行为，不受资助机构的影响
(vi) 尊重-尊重同事及适用于研究的道德政策/规则
(vii) 负责-向资助方和社会履行应有责任。
应用范围
该政策适用于所有在CAS-JIC联合研究中心所属实验室工作及参与CAS-JIC联合研究中心合作项目的研究人员。该政策通过各研究所的既定程序执行并巩固。研究人员将须同样遵守其所属研究所的流程及要求。CAS-JIC联合研究中心研究组长作为多个研究所的研究员，将须同时遵守其所属研究所及英国约翰英纳斯中心的流程及要求。
交流
这项政策将传达给所有在CAS-JIC联合研究中心工作和参与该中心合作项目的研究人员。该政策将在CAS-JIC联合研究中心官方网站上进行公示。
