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研究队伍

研究员

    辛秀芳


    研究员,博士生导师


    E-mail: xinxf@sippe.ac.cn


    研究方向:植物与环境微生物互作

 

个人简介
2004.9-2008.6
本科 中国农业大学 生物学院
 
2008.8-2014.4
博士 美国密歇根州立大学
DOE-Plant Research Laboratory
2014.4-2017.8
博士后 美国密歇根州立大学
DOE-Plant Research Laboratory
2017.8-
至今 中科院上海植物生理与生态研究所

 

研究工作
植物在生长过程中与环境微生物有密切的互作;其中病原微生物可使植物致病,从而在农业中大幅降低作物的产量,而微生物群 (microbiome) 对植物的生长、抗病等性状也 有重要调节作用。本课题组运用分子生物学、植物遗传学、生物化学、细胞生物学、生物信息学等多种手段,以拟南芥和水稻等为研究对象,在以下几个方向开展研究工作:


1.
病原菌的致病机制
革兰氏阴性病原细菌可通过III型分泌系统向植物细胞内分泌毒性蛋白-III型效应子 (effector),这些III型效应子对病原菌致病有至关重要的作用。目前以拟南芥-丁香假单胞杆菌 (Pseudomonas syringae) 为模式系统研究病原菌的III型效应子使植物致病的分子机制。

2.
环境因素影响病原菌致病的分子机制
除了具致病力的病原菌和可感病的宿主,病原菌使植物致病还需要合适的环境条件(如合适的温度、湿度等),但是目前对环境因素影响植物致病的分子机制的研究还很少。我们将以拟南芥和水稻为对象,研究环境因素(湿度)影响植物免疫反应的分子基础,从而为通过调控植物对环境湿度的反应而提高植物的抗病性提供新的思路。

3.
植物与微生物群互作
植物与微生物群互作是植物学研究的一个新兴领域,微生物群对植物的生长、抗病等性状有着重要的调节作用。正常条件下植物体内的微生物群达到一定的平衡状态,这一失衡状态的打破会影响植物的健康生长。我们将以拟南芥等为研究对象,运用遗传学、基因组学等手段解析植物调控体内微生物群(水平和组分)的重要机制。

 

主要论文

1.Major IT, Yoshida Y, Campos ML, Kapali G, Xin XF, Sugimoto K, de Oliveira Ferreira D, He SY, Howe GA. (2017) Regulation of growth-defense balance by the JAZ-MYC transcriptional module. New Phytol. accepted

2.Xin XF, Nomura K, Aung K, Vel
á
squez AC, Yao J, Boutrot F, Chang JH, Zipfel C, He SY (2016) Bacteria establish an aqueous living space in plants crucial for virulence. Nature 539: 524-529.
-Featured in the News sections of Nature;
-Commented by Dev. Cell and Cell Systems; 
-Recommended by F1000Prime;

3.Zhao Y, Huang J, Wang Z, Jing S, Wang Y, Ouyang Y, Cai B, Xin XF, Liu X, Zhang C, Pan Y, Ma R, Li Q, Jiang W, Zeng Y, Shangguan X, Wang H, Du B, Zhu L, Xu X, He SY, Feng YQ, Chen R, Zhang Q, He G. (2016) Allelic diversity in an NLR gene BPH9 enables rice to combat planthopper variation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 113:12850-5.

4.Xin XF, Nomura K, Ding X, Aung K, Chen X, Wang K, Uribe F, Yao J, Chen J, He SY (2015) Pseudomonas syringae effector AvrE localizes to the host plasma membrane and down-regulates the expression of the NDR/HIN1-like 13 gene required for antibacterial immunity in Arabidopsis. Plant Physiol.169:793-802.

5.Zhang L, Yao J, Withers J, Xin XF, Banerjee R, Fariduddin Q, Nakamura Y, Nomura K, Howe GA, Boland W, Yan H, He SY (2015) Host target modification as a strategy to counter pathogen hijacking of the jasmonate hormone receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112:14354-9.

6.Zhang F, Yao J, Ke J, Zhang L, Lam VQ, Xin XF, Zhou E, Chen J, Brunzelle J, Griffin PR, Zhou M, Xu E, Melcher K , He SY (2015) Structural basis of JAZ-mediated repression of MYC transcription factors in jasmonate signaling. Nature 525:269-73.

7.Guo L-B, Qiu J, Han Z, Ye Z, Chen C, Liu C, Xin XF, Y C, Wang Y-Y, Xie H, Wang Y, Bao J, Tang S, Xu J, Gui Y, Fu F, Wang W, Zhang X, Zhu Q, Guang X, Wang C, Cui H, Cai D, Ge S, Tuskan G, Yang X, Qian Q, He SY, Wang J, Zhou X, Fan L. (2015) A host plant genome after century-long endophyte infection. Plant J. 83:600-9.

8.Xin XF, He SY (2013) Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000: A model pathogen for probing disease susceptibility and hormone signaling in plants. Annu. Rev. Phytopathol. 51:473-98.

9.Xin XF, Underwood W, Nomura K, He SY (2013) Induction and suppression of PEN3 focal accumulation during Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 infection of Arabidopsis. Mol. Plant Microbe Interact. 26:861-7.

10.Yang Q, Chen ZZ, Zhou XF, Yin HB, Li X, Xin XF, Hong XH, Zhu JK, Gong Z (2009) Overexpression of SOS (Salt Overly Sensitive) genes increases salt tolerance in transgenic Arabidopsis. Mol. Plant 2:22
31.

11.Aung K, Xin XF, Mecey C, He SY (2016) Subcellular localization of Pseudomonas syringae pv. tomato effector proteins in plants. Type 3 Secretion Systems: Methods and Protocols 141-153. (Methods in Molecular Biology; Springer New York; book chapter)

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